Vedenie ústavu
| Riaditeľ: | doc. Mgr. Mário Ziman, PhD. |
| Zástupca riaditeľa: | Mgr. Andrej Gendiar, PhD. |
| Vedecký tajomník: | Mgr. Erik Bartoš, PhD. |
Správna rada
| Členovia: | Mgr. Andrej Herzáň, PhD. |
| Ing. Matej Jergel, DrSc. | |
| Dr.Rer.Nat. Ing. Mgr. Andrej Liptaj, PhD. | |
| Ing. Peter Švec, DrSc. | |
| doc. Mgr. Mário Ziman, PhD. |
Dozorná rada
| Predseda: | prof. RNDr. Peter Samuely, DrSc., akademik US Slovenska |
| Členovia: | Ing. Romana Jurkiewiczová |
| prof. Ing. Vladimír Nečas, PhD. |
Vedecká rada
| Predseda: | Mgr. Erik Bartoš, PhD. |
| Podpredsedkyňa: | RNDr. Naďa Mrkývková, PhD. |
| Členovia: | Ing. Irena Gejdoš Janotová, PhD. |
| Mgr. Martin Venhart, PhD. | |
| Externí členovia: | Ing. Marián Deanko, PhD. (Vacuumschmelze, s. r. o.) |
| Mgr. Martin Lištjak, PhD. (VÚJE) | |
| doc. RNDr. Jozef Strečka, PhD. (UPJŠ) |
Medzinárodný poradný zbor
| University Regensburg, Germany | prof. Dr. Jaroslav Fabian |
| University of Leoben, Austria | prof. Dr. Jürgen Eckert |
| Inst. of Nuclear Physics, Cracow, Poland | prof. dr hab. Robert Kamiński |
Zástupcovia ústavu
| Členka Snemu SAV: | RNDr. Katarína Gmucová, CSc. | predsedníčka 1. komory |
| Člen Predsedníctva SAV: | Mgr. Martin Venhart, PhD. | 1. oddelenie vied |
Kontaktné osoby na FÚ a SAV
- M. Venhart (FÚ SAV): spolupráca SR s CERN, Ženeva, Švajčiarsko
- E. Majková (FÚ SAV): národný delegát pre ERC granty
- D. Janičkovič (FÚ SAV): národný kontaktný bod pre 7RP EU a HORIZONT 2020 v oblasti „Nanotechnológie, moderné materiály, biotechnológie, moderná výroba a spracovanie“
- Š. Luby (FÚ SAV): národný delegát pre 7RP EU v oblasti „Bezpečnosť“
- P. Lobotka (ElÚ SAV): národný delegát pre 7RP EU v oblasti „Nanotechnológií“
- J. Pitel (ElÚ SAV): národný delegát pre 7RP EU v oblasti „Jadrový výskum (Euratom)“